Florence Malgoire donne des cours de maître, notamment à Gijón, à la Fondation Royaumont, à Sablé, au festival d’automne de Tokyo, à la Juilliard school de New-York et à Rio de Janeiro. Elle appartient également à l’équipe pédagogique de l’orchestre Baroque Français des jeunes. Depuis septembre 2000, elle enseigne le violon baroque à la Haute Ecole de Musique de Genève et depuis 2015 à la Schola Cantorum de Paris.
Enregistrement du disque « Genève au siècle des Lumières » au studio Ernest Ansermet :
